本發明涉及一種跑道式水產養殖水處理系統及其工藝方法,屬于水產養殖設備技術領域,圍繞魚池的周邊設置一段水處理池,所述水處理池從前往后依次為沉淀池、若干個相互串聯的水處理倉及調節池。當魚池水位上升溢流到水處理進水管,再流通至沉淀池,通過沉淀池翻水管,留入若干個多級串聯的水處理倉,水流通過填料層過濾,最終都流入調節池內,啟動循環泵,將調節池內的處理水打入魚池內。所述跑道式水產養殖水處理系統充分利用魚池間過道下的空間,節約了水處理設備占用空間,魚池中的養殖污水到沉淀池間的距離短,水處理倉利用水位差自動翻水,降低了水處理成本,獨立的水處理系統,能有效防止與其他養殖池的魚病交叉感染,本系統簡單、操作方便。